疱疹性咽峡炎主要是由于肠道病毒感染引起的上呼吸道传染病，主要通过粪-口传播、呼吸道飞沫传播以及接触传播。通常情况下，急性起病或急性的亚临床感染期是其主要的传染源，人群对肠道病毒普遍易感。
1.粪-口传播：由于进食被病毒污染的食物或者水源所导致，所以患者在饭前便后要洗手，不喝生水，不吃未洗干净和彻底煮熟的水果及蔬菜等，以免发生感染。
2.呼吸道飞沫传播：当一个已经患有疱疹性咽峡炎的人咳嗽、打喷嚏时，含有病毒的小液滴会从喉咙排出并悬浮在空气中，在那里可以存活一段时间，并可能被其他人吸入，从而引起感染。
3.接触传播：如果一个人接触到带有病毒的手指或其他表面，然后再触摸口腔咽喉部，则可能导致感染。因此，避免与有症状的人密切接触，特别是在他们咳嗽、打喷嚏或流鼻涕时，以减少感染的风险。